Ученые впервые детально описали, как вирус гриппа перепрограммирует клетку изнутри

Исследователи из Европейской лаборатории молекулярной биологии (EMBL) и их коллеги впервые детально описали, как вирус гриппа А перепрограммирует клеточную машинерию, отслеживая молекулярные взаимодействия прямо внутри инфицированных клеток. Работа опубликована в журнале Nature Microbiology и представляет собой первый масштабный анализ прямых контактов вирусных и человеческих белков в нативном контексте с достаточной структурной детализацией.

Для этого ученые применили модифицированную версию метода сшивки с масс-спектрометрией (XL-MS), адаптированную для вирус-инфицированных клеток. В отличие от традиционных биохимических методов, которые требуют разрушения клеток и могут приводить к артефактам, XL-MS позволяет фиксировать даже кратковременные и зависящие от локализации взаимодействия прямо в живой клетке. Полученные данные затем использовались для структурного моделирования с помощью модифицированной версии AlphaFold, что позволило предсказать, как именно вирусные и человеческие белки стыкуются друг с другом.

Исследование выявило два ключевых механизма, с помощью которых вирус берет под контроль клетку. Во-первых, ученые проследили путь гемагглютинина — поверхностного белка вируса, отвечающего за проникновение в клетку. Оказалось, что клеточные белки, некоторые с ранее неизвестными функциями, помогают вирусу правильно сворачивать и модифицировать гемагглютинин. Во-вторых, вирус вызывает растворение параспеклов — крошечных ядерных органелл, которые удерживают РНК-связывающие белки. Освобожденные белки затем используются вирусом для репликации. «Это не побочный эффект инфекции, а, возможно, стратегия», — отмечают авторы.

Хотя работа выполнена на лабораторном штамме вируса, методология применима и к потенциально пандемическим штаммам, таким как H5N1. Полученные данные открывают новые мишени для противовирусных препаратов и вакцин, однако требуют дальнейших исследований для подтверждения клинической значимости.